Uppopuut toimivat luonnollisena biologisena puhdistamona vesistöissä. Ne tarjoavat elinympäristön monille mikrobeille ja eliöille, jotka hajottavat vedessä olevia ravinteita ja orgaanista ainesta, parantaen näin vesistön laatua. Uppopuut edistävät myös kalojen ja muiden vesieliöiden elinolosuhteita luomalla suojapaikkoja ja lisääntymisalueita.
